В отдельных случаях возможно появление некоторых осложнений, например:

• Инфицирование органов мочевыделительной системы. Вследствие чего может развиться пиелонефрит, цистит, уретрит.
• Повреждение уретры, иногда значительное, вплоть до прободения.

Осложнения могут возникать из-за ошибок, допущенных при введении катетера, в особенности металлического, либо из-за недостаточного предварительного обследования пациента. Чаще всего осложнения возникают в результате нарушения асептичности.